Osasunaren kontuaren xedea da Euskal AEko instituzio-sektore guztiek osasunean izandako gastuak zenbatzea, haien finantzaketa modua zein egituretan egindako inbertsioa ezagutzea, aipatutako gastuak eragin dituztenak, hain zuzen. Informazio iturriak Osasun Sailaren datu administratiboak dira eta eragiketa hauek: Osasun arreta pribatuaren estatistika eta Familia gastuaren estatistika. Beste helburu bat osasungintzako sektoreko makromagnitudeak osatzea da, ELGAko Osasun Kontuen Sistemaren printzipio metodologikoei jarraitzen zaie, eta aztertzen dira Euskal AEko ekonomian duen eragina eta nazioarteko alderaketa.