La operación Cuenta de la Protección Social tiene como objetivo el cómputo del gasto y el ingreso de los sistemas de protección social, realizados en la C.A. de Euskadi por cualquier organismo público o privado, distribuido en cuatro grandes grupos: el Sistema de la Seguridad Social, el Servicio Público de Empleo Estatal, Regímenes de Funcionarios Públicos y Otros Sistemas con Funciones de Protección Social, y sigue los principios metodológicos del Sistema Europeo de Cuentas Integradas de la Protección Social. La elaboración de las principales macromagnitudes del sector permite analizar su impacto en la economía de la C.A. de Euskadi y su comparación internacional.